MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus M.14.25 chromosome

Total Repeats: 9383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012588	CAT	2	6	24	29	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012588	TAT	2	6	30	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012588	CCT	2	6	46	51	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_012588	TC	3	6	60	65	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_012588	TCATT	2	10	94	103	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_012588	TTTC	2	8	133	140	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_012588	GT	3	6	178	183	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012588	ATT	2	6	289	294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012588	GTCAC	2	10	356	365	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_012588	ATT	2	6	382	387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012588	TAA	2	6	432	437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012588	T	6	6	443	448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012588	TAAA	2	8	2364	2371	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012588	TA	5	10	2380	2389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012588	T	7	7	3246	3252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012588	T	6	6	3271	3276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012588	TAT	2	6	4870	4875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012588	TACAAA	2	12	5739	5750	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_012588	TAT	2	6	5836	5841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012588	AAG	2	6	5874	5879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012588	TTAAA	2	10	5880	5889	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012588	ACA	2	6	5893	5898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_012588	ATT	2	6	6049	6054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012588	GAA	2	6	6091	6096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012588	ATGTT	2	10	6109	6118	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012588	GA	3	6	6161	6166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012588	ATC	2	6	6185	6190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012588	GTTC	2	8	6199	6206	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_012588	TCA	2	6	6208	6213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012588	T	6	6	7691	7696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012588	TA	3	6	7711	7716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012588	TA	3	6	9053	9058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012588	GTA	2	6	9066	9071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012588	CATC	2	8	9900	9907	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_012588	ATT	2	6	16336	16341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012588	TGGTAT	2	12	17804	17815	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012588	TAA	2	6	17841	17846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012588	TAT	2	6	17903	17908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012588	CAT	2	6	17929	17934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012588	GGTT	2	8	17949	17956	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012588	CATA	2	8	17961	17968	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_012588	ATT	2	6	17975	17980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012588	TAT	2	6	17990	17995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012588	GAT	2	6	24559	24564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012588	TGA	2	6	24588	24593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012588	GAT	2	6	24612	24617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012588	TAGA	2	8	24632	24639	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012588	ATA	2	6	24660	24665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012588	CA	3	6	26323	26328	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012588	AT	3	6	26329	26334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012588	TAG	2	6	27044	27049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012588	CTAATA	2	12	27058	27069	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_012588	TAG	2	6	27084	27089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012588	TAATAC	2	12	27110	27121	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_012588	AAAAT	2	10	27147	27156	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012588	ATAA	2	8	28217	28224	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012588	TA	3	6	28232	28237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012588	TTA	2	6	31428	31433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012588	AGA	2	6	31460	31465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012588	AT	3	6	32695	32700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012588	CTTTTC	2	12	32720	32731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012588	ATC	2	6	32775	32780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_012588	ACA	2	6	32785	32790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_012588	TAA	2	6	34211	34216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012588	TAC	2	6	34247	34252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_012588	GGT	2	6	34262	34267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012588	T	6	6	35279	35284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012588	ACT	2	6	36974	36979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_012588	TATTTA	2	12	38249	38260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012588	A	6	6	38287	38292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012588	AT	4	8	38490	38497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012588	ATTT	2	8	38504	38511	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012588	AAAT	2	8	38515	38522	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012588	AT	3	6	38524	38529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012588	AAAT	2	8	38580	38587	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012588	AT	3	6	38586	38591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012588	GAT	2	6	38612	38617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012588	CTG	2	6	38653	38658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012588	ATT	2	6	38684	38689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012588	TTC	2	6	38710	38715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012588	GGT	2	6	38725	38730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012588	TAA	2	6	38776	38781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012588	TAA	2	6	38870	38875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012588	ATT	2	6	38983	38988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012588	AATA	2	8	38990	38997	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012588	TGGTG	2	10	39030	39039	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012588	AT	3	6	40787	40792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012588	TA	4	8	42461	42468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012588	GTT	2	6	44731	44736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012588	TTA	2	6	44750	44755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012588	ATC	2	6	44770	44775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_012588	TAGC	2	8	45772	45779	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_012588	TAA	2	6	45869	45874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012588	GTT	2	6	45882	45887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012588	TGA	2	6	45939	45944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012588	T	7	7	45952	45958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012588	TCT	2	6	45972	45977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_012588	TC	3	6	48107	48112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_012588	TCTAGT	2	12	48119	48130	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_012588	TCAA	2	8	48191	48198	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_012588	TTA	2	6	48216	48221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012588	AGA	2	6	48228	48233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012588	TAT	2	6	48252	48257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012588	TAT	2	6	49680	49685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012588	ATA	2	6	49686	49691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012588	T	7	7	50847	50853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012588	TTC	2	6	50868	50873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_012588	T	6	6	50894	50899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012588	TTG	2	6	50911	50916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012588	AAGT	2	8	50986	50993	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012588	CAA	2	6	51026	51031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_012588	TTAT	2	8	51062	51069	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012588	ATCT	2	8	51077	51084	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_012588	AGA	2	6	58211	58216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012588	CA	3	6	58889	58894	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_012588	TAA	2	6	58895	58900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012588	AAG	2	6	58932	58937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012588	TCC	2	6	58962	58967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_012588	TGA	2	6	58983	58988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012588	ATG	2	6	59008	59013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012588	T	7	7	59047	59053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012588	TAATT	2	10	61015	61024	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012588	CTT	2	6	61067	61072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_012588	GTTT	2	8	65368	65375	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012588	TAT	2	6	65386	65391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012588	A	6	6	65441	65446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012588	ATT	2	6	65470	65475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012588	TTG	2	6	68094	68099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012588	TAA	2	6	68140	68145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012588	TCAT	2	8	68160	68167	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_012588	ACT	2	6	68855	68860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_012588	TCTA	2	8	68888	68895	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_012588	A	7	7	68895	68901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012588	TTC	2	6	68928	68933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_012588	TAA	2	6	68972	68977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012588	TAA	2	6	69020	69025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012588	TAT	2	6	69026	69031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012588	AT	4	8	69047	69054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012588	TTC	2	6	69616	69621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_012588	CAT	3	9	69642	69650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_012588	TA	3	6	70173	70178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012588	TA	3	6	70216	70221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012588	CT	3	6	71535	71540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_012588	TAT	2	6	71591	71596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012588	AAC	2	6	72027	72032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_012588	AATAAA	2	12	72037	72048	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012588	GTTTT	2	10	72053	72062	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012588	GAT	2	6	72947	72952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_012588	ATA	2	6	80767	80772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_012588	ATA	2	6	100402	100407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_012588	ATT	2	6	120485	120490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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443	NC_012588	TAT	2	6	242327	242332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_012588	ATT	2	6	243387	243392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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473	NC_012588	AAT	2	6	253423	253428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_012588	TA	3	6	254644	254649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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